type
status
date
slug
summary
tags
category
icon
password
最初的准备
细胞的准备
- 包装细胞:293T细胞
- 用于包装慢病毒的细胞最好只传代7-10代
- 培养通常使用90%DMEM+10%FBS+GLutaMax(具体剂量不知)
Transfer Plasmid的大小
- 在LTR之间可以插入的基因长度约8.5k,但超过3k就会影响效率
- 非必要不要带其他元件
- 需要考虑是否抛弃TAT
病毒稳定性评估
- VSV-G包膜慢病毒对pH极为敏感
物品准备
质粒
- Thansfer Plasmid(第二代或者第三代)
- VSV-G:pMD2.G(addGene#12259)
- Rev:pRSV-Rev(addGene#12253)
- Gag/Pol:pMDLg/pRRE(addGene#12251)
- Tat:pCEP4-tat(addGene#22502)——可要可不要
- pSpAx2
细胞系
1.低传代数293T细胞
试剂
- 293T培养基:高糖DMEM+10%FBS+GlutaMax
- 病毒收获培养基:取50ml 293T培养基,加入0.5g BSA(Sigma A9418)和最终浓度为10mM的HEPES,0.22um过滤
- Opti-MEM:用于混合转染复合物
- 转染试剂:X-tremeGENE HP DNA(或其他低毒性高效率的试剂)
- 无内毒素质粒提取试剂盒
- Polybrene(10mg/ml):用于感染实验
实验步骤
第一天
根据下表种植293T细胞
ㅤ | 六孔板 | 10cm皿 | 15cm皿 |
seeding number | 8.75*10^5 | 5.5*10^6 | 1.8*10^7 |
Medium volume | 1.5-2ml | 5-6ml | 15-17ml |
Transfer plasmid | 1.2ug | 6ug | 16.6ug |
VSV-G | 0.24ug | 1.2ug | 3.4ug |
Rev | 0.12ug | 0.6ug | 1.7ug |
Gag/Pol | 0.12ug | 0.6ug | 1.7ug |
Tat | 0.12ug | 0.6ug | 1.7ug |
Opti-MEM | 200ul | 1ml | 2ml |
X-tremeGENE | 5.4ul | 27ul | 74.5ul |
第二天-上午
根据上表准备混合Opti-MEM培养基、质粒和转染试剂
第二天-下午
转染4-6h后更换病毒收获培养基
第三天:无事
第四天:
转染48h后,取细胞上清液于400x G离心4min,并用0.45um过滤,以彻底移除杂质,粗制品分装后,-80摄氏度保存。
可选:再加病毒收获培养基
第五天:
转染72小时后再次回收上清液,于400x G离心4min,并用0.45um过滤,以彻底移除杂质,粗制品分装后,-80摄氏度保存。
病毒浓缩(可选)
试剂:通用型病毒浓缩试剂盒
产品编号:C2901S
操作方法:
- 使用培养的细胞包装病毒完成后,收集含病毒上清液,4摄氏度,3500*G离心10min,以充分沉淀细胞碎片,小心吸取上清液用于后续浓缩
- 也可以取含病毒上清液,使用0.45um枕头滤器(FF365/FF375)过滤以充分沉淀细胞碎片。
- 去除4摄氏度预冷的病毒沉淀试剂(4X),1份病毒沉淀试剂:3份病毒上清液的比例混合,摇床上4度至少4h或过夜。(不宜超过24小时)
- 小心吸除上清
病毒滴度检测及应用
流式检测
适用于带GFP或有相应的流式抗体的慢病毒
- 将CHO或者293T接种于24孔板中,10^5/孔
- 加入助转试剂(polybrane)
- 加入病毒液:浓缩后病毒液稀释10倍加入1ul,2.5ul,5ul;原液5ul,10ul,25ul
- 病毒加入48h后收集上述细胞,进行流式检验
- 计算公式:病毒滴度(Tu/ml)=1e5 * 阳性率 / 体积 * 稀释倍率 * 1000
~~~
当检验结果阳性率大于30%时,计算结果可能不准确
~~~
qPCR
- 将CHO或者293T接种于24孔板中,10^5/孔
- 加入助转试剂(polybrane)
- 加入病毒液:浓缩后病毒液稀释10倍加入1ul,2.5ul,5ul;原液5ul,10ul,25ul
- 病毒加入48h后收集上述细胞,提取基因组,绝对定量PCR检测GAG或WPRE拷贝数以及Alb拷贝数
- 计算公式
~~~
- 提取基因组前应用DNasel对细胞进行处理
- 体积与拷贝数之间应该呈线性
~~~
注意事项
- 流式检测慢病毒滴度通常浓缩液为:1e7~1e9 Tu/ml
- 慢病毒感染病毒细胞时应当选择适当的MOI(感染复数),公式如下:
- 对于CHO等容易感染的细胞MOI=1,不容易感染的细胞应选择其他MOI。
致谢:
有关Notion安装或者使用上的问题,欢迎您在底部评论区留言,一起交流~