🗒️ 😳鸽子的实验笔记-包病毒
2024-11-11
| 2024-11-12
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最初的准备

细胞的准备

  1. 包装细胞:293T细胞
  1. 用于包装慢病毒的细胞最好只传代7-10代
  1. 培养通常使用90%DMEM+10%FBS+GLutaMax(具体剂量不知)

Transfer Plasmid的大小

  1. 在LTR之间可以插入的基因长度约8.5k,但超过3k就会影响效率
  1. 非必要不要带其他元件
  1. 需要考虑是否抛弃TAT
 

病毒稳定性评估

  1. VSV-G包膜慢病毒对pH极为敏感
 

物品准备

质粒

  1. Thansfer Plasmid(第二代或者第三代)
  1. VSV-G:pMD2.G(addGene#12259)
  1. Rev:pRSV-Rev(addGene#12253)
  1. Gag/Pol:pMDLg/pRRE(addGene#12251)
  1. Tat:pCEP4-tat(addGene#22502)——可要可不要
  1. pSpAx2
 

细胞系

1.低传代数293T细胞
 

试剂

  1. 293T培养基:高糖DMEM+10%FBS+GlutaMax
  1. 病毒收获培养基:取50ml 293T培养基,加入0.5g BSA(Sigma A9418)和最终浓度为10mM的HEPES,0.22um过滤
  1. Opti-MEM:用于混合转染复合物
  1. 转染试剂:X-tremeGENE HP DNA(或其他低毒性高效率的试剂)
  1. 无内毒素质粒提取试剂盒
  1. Polybrene(10mg/ml):用于感染实验
 

实验步骤

第一天

根据下表种植293T细胞
六孔板
10cm皿
15cm皿
seeding number
8.75*10^5
5.5*10^6
1.8*10^7
Medium volume
1.5-2ml
5-6ml
15-17ml
Transfer plasmid
1.2ug
6ug
16.6ug
VSV-G
0.24ug
1.2ug
3.4ug
Rev
0.12ug
0.6ug
1.7ug
Gag/Pol
0.12ug
0.6ug
1.7ug
Tat
0.12ug
0.6ug
1.7ug
Opti-MEM
200ul
1ml
2ml
X-tremeGENE
5.4ul
27ul
74.5ul

第二天-上午

根据上表准备混合Opti-MEM培养基、质粒和转染试剂

第二天-下午

转染4-6h后更换病毒收获培养基
 

第三天:无事

第四天:

转染48h后,取细胞上清液于400x G离心4min,并用0.45um过滤,以彻底移除杂质,粗制品分装后,-80摄氏度保存。
可选:再加病毒收获培养基

第五天:

转染72小时后再次回收上清液,于400x G离心4min,并用0.45um过滤,以彻底移除杂质,粗制品分装后,-80摄氏度保存。

病毒浓缩(可选)

试剂:通用型病毒浓缩试剂盒
产品编号:C2901S
操作方法:
  1. 使用培养的细胞包装病毒完成后,收集含病毒上清液,4摄氏度,3500*G离心10min,以充分沉淀细胞碎片,小心吸取上清液用于后续浓缩
  1. 也可以取含病毒上清液,使用0.45um枕头滤器(FF365/FF375)过滤以充分沉淀细胞碎片。
  1. 去除4摄氏度预冷的病毒沉淀试剂(4X),1份病毒沉淀试剂:3份病毒上清液的比例混合,摇床上4度至少4h或过夜。(不宜超过24小时)
  1. 小心吸除上清

病毒滴度检测及应用

流式检测

适用于带GFP或有相应的流式抗体的慢病毒
  1. 将CHO或者293T接种于24孔板中,10^5/孔
  1. 加入助转试剂(polybrane)
  1. 加入病毒液:浓缩后病毒液稀释10倍加入1ul,2.5ul,5ul;原液5ul,10ul,25ul
  1. 病毒加入48h后收集上述细胞,进行流式检验
  1. 计算公式:病毒滴度(Tu/ml)=1e5 * 阳性率 / 体积 * 稀释倍率 * 1000
~~~
当检验结果阳性率大于30%时,计算结果可能不准确
~~~

qPCR

  1. 将CHO或者293T接种于24孔板中,10^5/孔
  1. 加入助转试剂(polybrane)
  1. 加入病毒液:浓缩后病毒液稀释10倍加入1ul,2.5ul,5ul;原液5ul,10ul,25ul
  1. 病毒加入48h后收集上述细胞,提取基因组,绝对定量PCR检测GAG或WPRE拷贝数以及Alb拷贝数
  1. 计算公式
~~~
  1. 提取基因组前应用DNasel对细胞进行处理
  1. 体积与拷贝数之间应该呈线性
~~~

注意事项

  1. 流式检测慢病毒滴度通常浓缩液为:1e7~1e9 Tu/ml
  1. 慢病毒感染病毒细胞时应当选择适当的MOI(感染复数),公式如下:
  1. 对于CHO等容易感染的细胞MOI=1,不容易感染的细胞应选择其他MOI。
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